Ein zweites Windows zu installieren, würde heißen, auch Treiber und Programme und alles neu installieren zu müssen. Selbstständig finden wird der da nix, oder erst, wenn man ihn mit der Nase draufstubst. Aber dann kann mans auch gleich selber machen

Außerdem ists möglich, dass das zweite Windows nicht mehr bootet, wenn du die erste Festplatte ausbaust!
Was natürlich kein Problem wäre, wenn du die 120er gleich als erste Platte einbaust (und die 40er am besten raus), Windows installierst und dann erst die 40er wieder rein. Aber dann hast du trotzdem noch den Stress mit den Treibern. Der beim Kopieren der Partition erspart bliebe